09-11-2026

Investigador Predoctoral (FPI) - G.Santpere

Ref.:

FIMIM3343-SANTPERE

Institución:

FUNDACIÓ IMIM

Investigador/es responsable/s del proyecto:

Gabriel Santpere Baró

Titulo del proyecto:

Ayudas para contratos predoctorales para la formación de doctores 2025 (FPI)

Grupo / Servicio:

Grupo de investigación en neurogenómica

Descripción del área:

El Instituto de Investigación del Hospital del Mar busca a un/a Investigador/a Predoctoral (FPI) para incorporarse al Grupo de investigación en neurogenómica, liderado por GABRIEL SANTPERE BARÓ, ubicado en el Parque de Investigación Biomédica de Barcelona (PRBB). El proyecto PRONEURO-SYNTAX (Syntax y dynamics of proneural bHLH factores in primate neurogenesis and neuropsychiatric vulnerability) investiga los mecanismos moleculares que regulan la neurogénesis cortical, centrándose en la actividad de los factores de transcripción proneurales de la familia bHLH (TCF) su interacción con la cromatina. El proyecto combina técnicas de genómica funcional y epigenómica, incluyendo CUT&Tag, single-cell RNA-seq, ATAC-seq y multiómica, para estudiar la regulación génica durante la diferenciación neuronal en modelos derivados de células madre pluripotentes humanas y otros primates. La persona contratada desarrollará principalmente la parte bioinformática del proyecto, integrando datos ómicos para caracterizar las redes de regulación génica, la dinámica de la cromatina y los mecanismos evolutivos asociados al desarrollo cortical y la vulnerabilidad neuropsiquiátrica.

Principales responsabilidades:

- Procesamiento de datos CUT&Tag, identificación de regiones de unión de factores de transcripción y análisis de motivos reguladores E-box. - Análisis de datos multi-ómicos (RNA + ATAC) para caracterizar las trayectorias de maduración de progenitores neuronales y los cambios en la accesibilidad de la cromatina. - Integración de datos de unión de factores de transcripción, accesibilidad de la cromatina y expresión génica para reconstruir redes reguladoras y cuantificar la actividad proneural. - Análisis comparativo de datos genómicos y epigenómicos entre humanos y otros primates para identificar cambios evolutivos en la regulación génica. - Integración de los resultados con datos genéticos de trastornos neuropsiquiátricos. - Desarrollar e implementar pipelines bioinformáticos para el procesamiento y análisis de datos de secuenciación masiva. - Analizar e integrar datos transcriptómicos y epigenómicos, especialmente de single-cell RNA-seq, ATAC-seq y CUT&Tag. - Aplicar metodologías computacionales para inferir redes de regulación génica y estudiar la dinámica de la diferenciación neuronal. - Desarrollar herramientas de análisis y visualización de datos, garantizando la reproducibilidad de los resultados. - Colaborar con los investigadores del grupo y participar en reuniones, publicaciones científicas y congresos.

¿Qué necesitamos?

- Grado universitario en Biología, Biotecnología, Bioinformática o disciplinas relacionadas. - Máster en Bioinformática, Biología Computacional o titulación equivalente. - La persona seleccionada deberá disponer de la carta de admisión y/o estar matriculada en un programa de doctorado antes del inicio de la relación laboral. - Conocimientos de programación y análisis de datos con Python y/o R. - Experiencia en el análisis de datos ómicos, especialmente transcriptómica y datos single-cell. - Conocimientos de entornos Linux y herramientas de procesamiento de datos de secuenciación. - Buen nivel de inglés científico. - Persona motivada por la investigación, con capacidad de aprendizaje, autonomía y predisposición para trabajar en un entorno multidisciplinar. - Cumplir los requisitos de elegibilidad para un contrato predoctoral FPI. Se valorará positivamente: - Experiencia en el análisis de datos de cromatina (ATAC-seq, ChIP-seq o CUT&Tag). - Conocimientos de genómica reguladora, inferencia de redes génicas y genómica comparativa. - Experiencia con computación de alto rendimiento (HPC), desarrollo de pipelines y herramientas de reproducibilidad. - Conocimientos de estadística, machine learning o modelización computacional. - Interés por la neurociencia y el desarrollo del sistema nervioso.

¿Qué ofrecemos?

- Contrato predoctoral - Entorno de trabajo estimulante y multidisciplinar. - Desarrollo de una tesis doctoral vinculada al Programa de Doctorado en Biomedicina de la Universitat Pompeu Fabra. - Incorporación al Grupo de Neurogenómica del GRIB – Hospital del Mar Research Institute, ubicado en el Parque de Investigación Biomédica de Barcelona (PRBB). - Formación avanzada en bioinformática, genómica funcional, epigenómica y neurociencia del desarrollo. - Participación en colaboraciones científicas internacionales, publicaciones y congresos. - Incorporación a un equipo internacional y altamente colaborativo. - Oportunidades de formación y desarrollo profesional.

Información adicional:

Criterios de Selección Criterio 1. Trayectoria académica y/o científico-técnica del candidato/a (hasta 50 puntos). Subcriterio 1.a): Aportaciones científico-técnicas (hasta 45 puntos). Se valorará el expediente académico y otros méritos curriculares del candidato/a, así como la adecuación de los mismos a las tareas a realizar en función de la formación y experiencia profesional. Subcriterio 1.b): Movilidad e internacionalización (hasta 5 puntos). Se valorará la relevancia y el impacto en su trayectoria investigadora de las estancias del candidato/a en centros nacionales e internacionales y/o en el sector industrial, atendiendo al prestigio de la entidad de recepción de la estancia y a la actividad desarrollada en la misma. Criterio 2. Adecuación de la persona candidata a las actividades de investigación a desarrollar (hasta 50 puntos). Se valorará la adecuación de la persona al programa, proyecto o actividades de investigación a desarrollar en función de su formación y experiencia previas. Para ello, se tendrá en cuenta el valor añadido que la realización del proyecto representará para su carrera investigadora, así como el valor aportado al centro y al equipo receptor. Condicions d’incorporació: La formalització del contracte està condicionada a la resolució favorable de la convocatòria de l’ajut (FPI). La incorporació de la persona seleccionada només podrà fer-se efectiva el dia 1 d’un mes.

Contrato:

Pre-doctoral LL.C. 12p

Horario	Retribución	Data de incorporación
Contrato a jornada completa.	22251.77 € bruts anuals